Sebagai besar pulau di Indonesia terbentuk akibat adanya pertemuan antar lempeng. Namun banyak juga pulau-pulau yang terbentuk secara alamiah dari proses pengendapan karang, koral, maupun binatang laut. Proses tersebut biasanya terjadi pada laut dengan kondisi yang relatif tenang (ombak dan arusnya tidak begitu kuat). Pulau Gosong merupakan salah satu dari beberapa pulau-pulau kecil di Kepulauan Seribu yang terbentuk karena proses pengendapan karang, koral, maupun binatang laut. Ciri utama pulau-pulau ini adalah ukurannya yang tidak begitu luas dan proses terbentuknya cukup lama.